拥有国家中医优势专科2个（心病科、康复科）、国家级临床重点专科1个（骨伤科）、骨伤科等省中医药管理局重点学科5个、治未病科等省中医优势专科3个、肝脾胃科等省中医重点专科4个、省中医重点研究室10个、省级重点研究室10个、中医老年病诊疗中心等吉林省第一批中医药“五大中心”建设项目3个、中医妇科质控中心等省中医质控中心3个、市级重点专科22个，同时承担14个各级专委会主任委员单位职责。市级医学重点专科8个（骨伤科、糖尿病科、肾病内科、康复科、脑病科、中医心病科、肛肠科、老年病科）；急诊科等市级中医重点专科13个。

长春市中医院成立于1954年，是集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的中医特色突出的市属三级甲等中医院，是长春中医药大学第二附属医院，是国家现代医院管理制度试点单位和吉林省薪酬制度改革、职称自主评聘改革试点单位。医院一院三址，总占地面积4.6万平方米，总建筑面积7.4万平方米，分别是总部（宽城区台北大街1913号）、平阳部（南关区曙光路463号）和东部（二道区和顺三条115号），总编制床位数1075张，实际开放床位数1350张。